MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli BL21(DE3) chromosome

Total Repeats: 93348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012971	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012971	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012971	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012971	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012971	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012971	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286928
7	NC_012971	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286928
8	NC_012971	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012971	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012971	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012971	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
12	NC_012971	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	254286929
13	NC_012971	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	254286929
14	NC_012971	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	254286929
15	NC_012971	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
16	NC_012971	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
17	NC_012971	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	254286929
18	NC_012971	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286929
19	NC_012971	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
20	NC_012971	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
21	NC_012971	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	254286929
22	NC_012971	GC	3	6	753	758	0 %	0 %	50 %	50 %	254286929
23	NC_012971	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
24	NC_012971	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286929
25	NC_012971	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286929
26	NC_012971	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
27	NC_012971	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
28	NC_012971	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
29	NC_012971	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	254286929
30	NC_012971	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
31	NC_012971	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	254286929
32	NC_012971	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
33	NC_012971	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286929
34	NC_012971	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
35	NC_012971	AAT	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254286929
36	NC_012971	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
37	NC_012971	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	254286929
38	NC_012971	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
39	NC_012971	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
40	NC_012971	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	254286929
41	NC_012971	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286929
42	NC_012971	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286929
43	NC_012971	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286929
44	NC_012971	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
45	NC_012971	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
46	NC_012971	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
47	NC_012971	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286929
48	NC_012971	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	254286929
49	NC_012971	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286929
50	NC_012971	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
51	NC_012971	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286929
52	NC_012971	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	254286929
53	NC_012971	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286929
54	NC_012971	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
55	NC_012971	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
56	NC_012971	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286929
57	NC_012971	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
58	NC_012971	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
59	NC_012971	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286929
60	NC_012971	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
61	NC_012971	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	254286929
62	NC_012971	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
63	NC_012971	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286929
64	NC_012971	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	254286929
65	NC_012971	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
66	NC_012971	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286929
67	NC_012971	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	254286929
68	NC_012971	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254286929
69	NC_012971	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286929
70	NC_012971	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286930
71	NC_012971	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286930
72	NC_012971	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286930
73	NC_012971	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	254286930
74	NC_012971	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286930
75	NC_012971	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	254286930
76	NC_012971	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286930
77	NC_012971	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286930
78	NC_012971	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286930
79	NC_012971	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286930
80	NC_012971	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286930
81	NC_012971	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	254286930
82	NC_012971	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286930
83	NC_012971	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286930
84	NC_012971	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	254286930
85	NC_012971	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	254286930
86	NC_012971	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	254286930
87	NC_012971	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286930
88	NC_012971	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	254286930
89	NC_012971	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	254286930
90	NC_012971	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	254286930
91	NC_012971	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286930
92	NC_012971	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	254286931
93	NC_012971	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	254286931
94	NC_012971	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
95	NC_012971	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
96	NC_012971	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	254286931
97	NC_012971	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286931
98	NC_012971	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286931
99	NC_012971	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
100	NC_012971	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286931
101	NC_012971	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	254286931
102	NC_012971	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286931
103	NC_012971	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286931
104	NC_012971	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286931
105	NC_012971	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286931
106	NC_012971	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286931
107	NC_012971	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286931
108	NC_012971	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286931
109	NC_012971	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
110	NC_012971	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	254286931
111	NC_012971	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286931
112	NC_012971	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286931
113	NC_012971	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286931
114	NC_012971	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286931
115	NC_012971	T	6	6	5069	5074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012971	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012971	AAC	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012971	CGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012971	GCA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254286932
120	NC_012971	TGG	2	6	5397	5402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286932
121	NC_012971	ACA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254286932
122	NC_012971	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286932
123	NC_012971	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286932
124	NC_012971	CCA	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286932
125	NC_012971	CTC	2	6	5479	5484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254286932
126	NC_012971	ATC	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286932
127	NC_012971	CGG	2	6	5495	5500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254286932
128	NC_012971	AT	3	6	5611	5616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012971	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012971	GCT	2	6	5686	5691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286933
131	NC_012971	GGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254286933
132	NC_012971	TCA	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286933
133	NC_012971	AAG	2	6	5739	5744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254286933
134	NC_012971	CAGT	2	8	5764	5771	25 %	25 %	25 %	25 %	254286933
135	NC_012971	AAT	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254286933
136	NC_012971	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286933
137	NC_012971	TTC	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286933
138	NC_012971	TTC	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286933
139	NC_012971	CAC	2	6	5957	5962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286933
140	NC_012971	TGC	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286933
141	NC_012971	TTG	2	6	5997	6002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254286933
142	NC_012971	TGA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286933
143	NC_012971	AAATCG	2	12	6150	6161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254286933
144	NC_012971	AGCG	2	8	6268	6275	25 %	0 %	50 %	25 %	254286933
145	NC_012971	CTG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254286933
146	NC_012971	GTG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254286933
147	NC_012971	A	7	7	6494	6500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012971	CAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286934
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153	NC_012971	ATC	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286934
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157	NC_012971	GCC	2	6	7208	7213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286934
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167	NC_012971	A	6	6	7944	7949	100 %	0 %	0 %	0 %	254286934
168	NC_012971	GCAT	2	8	7954	7961	25 %	25 %	25 %	25 %	254286934
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170	NC_012971	TA	3	6	8023	8028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_012971	GGCG	2	8	8085	8092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_012971	CGG	2	6	8149	8154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_012971	CGT	2	6	8169	8174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_012971	ATC	2	6	8178	8183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_012971	CGCAG	2	10	8358	8367	20 %	0 %	40 %	40 %	254286935
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197	NC_012971	TGA	2	6	9302	9307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254286936
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251	NC_012971	TCTTT	2	10	11866	11875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
252	NC_012971	TTA	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_012971	T	6	6	11885	11890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_012971	ATTC	2	8	11910	11917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
255	NC_012971	A	6	6	11990	11995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_012971	TGA	2	6	12013	12018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012971	TAG	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012971	AGTG	2	8	12052	12059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012971	A	7	7	12067	12073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_012971	ATG	2	6	12129	12134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_012971	AT	3	6	12140	12145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012971	AAT	2	6	12169	12174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254286939
263	NC_012971	TAC	2	6	12190	12195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286939
264	NC_012971	ATGG	2	8	12215	12222	25 %	25 %	50 %	0 %	254286939
265	NC_012971	CAC	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286939
266	NC_012971	CAC	2	6	12262	12267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254286939
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397	NC_012971	CGC	2	6	18094	18099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254286943
398	NC_012971	CTT	2	6	18189	18194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254286943
399	NC_012971	AGCGA	2	10	18228	18237	40 %	0 %	40 %	20 %	254286943
400	NC_012971	GTGG	2	8	18258	18265	0 %	25 %	75 %	0 %	254286943
401	NC_012971	ATC	2	6	18361	18366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254286943
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405	NC_012971	GA	3	6	18707	18712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012971	ATT	2	6	22051	22056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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